我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我... 我通过转录组测序得到的基因序列ORF是不完整的。看到网上有人说可以通过 Blast找到和序列相似的其他物种的序列,通过序列比对找到保守区,在保守区设计引物就可以扩增DNA.还有人说ORF不完整要设计3”5“的引物通过RACE先将3”端5“端扩增出来拿到完整序列。我该做那一步呢,刚开始做,实验小白,求指教
用RACE扩增要还一些,用保守序列扩增一个问题是保守区位置不好,扩增后任然不是基因全长,第二个你是新手保守序列设计引物不一定能设计到合适的引物。