极性和非极性这两个概念经常和疏水亲水联系在一起。
根据相似相容原理,极性溶质溶于极性溶剂中,非极性溶质溶于非极性溶剂中。水经常作为溶剂,其是极性的。所以极性氨基酸可看作是溶于水的氨基酸,反之,则不易溶于水。
另一方面,你也可以从氨基酸结构来看,氨基酸的性质主要取决于侧链基团R,如果R只是H或是C、H两元素组成的话,都是疏水的,如果含有极性侧链基团,如-OH、-SH、-COOH、-NH2等,那么这个氨基酸就是极性的。
一般来说,和亲水疏水联系起来,例如大部分蛋白质表面多为极性性氨基酸,内部为非极性氨基酸,正常情况下,这些蛋白质溶于水,但是当其变性以后,内部的非极性氨基酸暴露出来,这时候蛋白质就沉淀了。