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【BEAM】重抗原筛选技术让您更快发现免疫细胞克隆型

2023-04-0494

尽管功能性的适应性免疫组库拥有巨大的治疗潜力,但传统方法仍难以将抗原靶点与特定的B细胞和T细胞受体(BCR/TCR)相匹配。

基于条形码的抗原特异性图谱(Barcode Enabled Antigen Mapping,BEAM ),能够以前所未有的单细胞分辨率快速发现抗原特异性B细胞(BEAM-Ab)和T细胞(BEAM-T),助力您获得新的生物学见解并推动免疫疗法开发。BEAM以成熟的单细胞免疫分析流程为基础,结合基因表达、V(D)J 测序和细胞表面蛋白表达筛选出推定抗原的BCR/TCR。

通过多重抗原筛选,您可以从同一样本中生成数十个至数百个高质量的候选物(hits),从而增加克隆型/受体的多样性和数量,用于治疗应用中的下游验证。1677205804763.png

图1 全面分析免疫组库并表征抗原特异性的克隆型

A. Feature Barcode技术以及独特的BEAM-Ab和BEAM-T试剂组件能够分别确定目标B细胞和T细胞的抗原特异性。

B. 在单细胞水平上获得抗原特异性B细胞或T细胞的全长配对V(D)J序列,以及全转录组基因表达(C)和细胞表面蛋白表达(D)的数据。

产品优势

1. 多重抗原筛选可从每个样本中鉴定出数十个至数百个候选物(hits);

2. 从样本到数据,仅需一周时间;

3. 以单细胞分辨率发现抗原特异性的克隆型;

4. 端对端的成套解决方案(包括试剂和样本制备指南)帮助您快速入门。

产品应用

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图2 BEAM技术应用方向

产品特点

BEAM-Ab

1. 无缝整合的端对端流程可在一周内从样本中获得高质量的抗体候选物;

2.对多达15种抗原进行并行筛选,从每个样本中生成数十个至数百个候选物,为您输送更多的候选抗体;

3. 直观的软件解决方案有助于鉴定扩增的抗原特异性克隆型,便于您高效选择理想的候选抗体进行下游验证。

BEAM-T

1. 利用现成的试剂盒以及可自行加载的MHC单体轻松制备肽段-MHC复合物,肽段可以灵活地从任何供应商处进行设计和购买;

2. 以单细胞分辨率检测罕见的和/或与治疗相关的TCR克隆型,以便全面了解免疫应答;

3. 轻松易用的软件解决方案有助于探索抗原-克隆型关系,获取单个样本中抗原反应性T细胞的整体多样性。


实验流程

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完整的数据分析解决方案

10x Genomics提供轻松易用的软件让BEAM流程变得完整,可根据特定抗原和V(D)J序列信息来分析数据和可视化。

1.根据特定的V(D)J序列从样本中鉴定出扩增的克隆型;

2. 对抗原特异性进行评分,以便确定感兴趣抗原和对照抗原之间表现出结合差异的克隆型,为下游验证策略提供信息;

3. Loupe V(D)J Browser 软件可根据抗原特异性评分对克隆型群体进行可视化和过滤。

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图4.  对抗原特异性淋巴细胞的BEAM数据进行可视化

A. t-SNE投影显示出按相关基因表达进行聚类的细胞,允许根据细胞类型进行分类和对独特的细胞簇进行更深入的分析。

B. Loupe V(D)J Browser可视化软件描绘出按每个抗原的UMI计数排布的抗原特异性克隆型,其中深红色表示抗原UMI计数较高。

C. 克隆型(X轴)相对抗原(Y轴)的热图,按照抗原特异性评分来着色,概括了抗原与克隆型的相互作用。


样本要求

与多种样本类型兼容,包括PBMC、脾细胞、淋巴结穿刺液以及富集的B细胞或者T细胞。


其它

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欢迎您联系我们,易研科技作为10x Genomics授权代理商,目前提供BEAM技术全套支持方案,包括且不限于技术交流、试剂提供、流式分选、建库实验指导、生信分析等都可以为您提供完善的支持。

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易研科技是10x Genomics的官方授权代理商,可为客户提供Chromium单细胞平台、Visium空间平台以及Xenium原位检测平台相关的产品技术讲解、仪器试剂销售及使用培训,以及相关测序数据的生物信息分析培训。

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