10x Genomics应用方案在脑疾病研究中的应用
2023-04-0456春天的生机已然来临,,怀揣着梦想,担负着责任。10x Genomics 2023年的技术宣讲Seminar,已拉开帷幕。
2023年2月9日下午,10x Genomics公司授权代理商北京易研科技有限公司在天坛医院中心脑库做了题为“10x Genomics应用方案在脑疾病研究中的应用”技术讲座,本次讲座由易研科技实验技术总监徐护朝老师主讲。
首先,徐老师按照以下六大主题向在座的老师们介绍了10x Genomics的全系列产品,并分享了在脑疾病研究中已发表的10x Genomics 相关文章。
10x Genomics三大技术平台
本次技术讲座过程中,听会的老师可以随时提问,与徐老师及时互动,精彩问题如下:
Q1:脑组织开展单细胞测序实验,样本制备有哪些可选择的方法,必须抽提细胞核吗?
答:不是必须抽提细胞核。对于冰冻组织,选择抽提细胞核开展单细胞测序。新鲜组织需要根据研究的细胞类型选择方法,若研究的细胞类型直径<40um,比如小胶质细胞,可以选择组织解离制备单细胞悬浮液,然后通过流式分选获取小胶质细胞;若细胞类型中包含直径>40um的细胞,那么需要选择抽提细胞核开展单细胞测序。
Q2:请问人脑石蜡包埋样本是否可以开展10x Genomics单细胞测序?
答:可以的。10x GenomicsZ新推出了针对FFPE样本的组织解离方案,然后搭配Chromium Fixed RNA Kit, Human Transcriptom,便可开展基于探针捕获方法的单细胞测序。除此之外,石蜡包埋样本也可以开展FFPE空间转录组,已完成HE染色的病理切片可以在Visium CytAssist平台开展空间转录组。
Q3:我们研究人脑的海马区域,10x Genomics空间转录组用的Slide 是否可以把人脑的海马区域全部贴进去?
答:目前10x Genomics空间转录组Z大可支持12mm x 12mm组织,如果组织面积太大可以考虑将组织切开放在不同的捕获区域。另外,10x GenomicsZ新上市的组织空间原位分析技术,能够实现亚细胞分辨率的靶向基因和蛋白表达原位分析,可以支持12mm x 24mm组织大小,老师可以关注一下该技术在脑疾病研究中的应用。
Q4:新鲜组织以前做冰冻空间转录组,反馈质检结果不合格,可能什么原因导致的?
答:导致质检值不合格的原因可能包含但不限于:(1)组织获取后未及时包埋或冷冻;(2)组织中的血液或水份未擦干;(3)包埋后保存条件不合适;(4)实验过程中的器材未去除RNA酶。
其次,徐老师向在座的老师们介绍到易研科技是可以为客户提供单细胞转录组/空间转录组整体解决方案的公司,包含实验设计,样本准备,组织解离,建库测序以及生信分析等。
Z后,讲座结束时,天坛医院中心脑库的黄主任对易研科技带来的精彩报告给予了肯定,感谢易研科技带来及时的新技术讲座,希望后续双方加强合作实现共赢。
易研科技10x Genomics技术宣讲Seminar将会贯穿整个2023年,如果您也想听一次10x Genomics全系列产品介绍,那就赶快跟我们约一下吧,我们欢迎您踊跃报名,希望易研的力量,能够助力您的科学研究。
会议精彩瞬间
关于北京易研科技有限公司
易研科技专注于为生命科学研究、基础医学研究等领域提供科研所需仪器试剂产品及科技服务。
易研科技是10x Genomics的官方授权代理商,可为客户提供Chromium单细胞平台、Visium空间平台以及Xenium原位检测平台相关的产品技术讲解、仪器试剂销售及使用培训,以及相关测序数据的生物信息分析培训。
同时易研科技也提供动物解剖、组织解离、流式细胞分选、质谱流式、蛋白多因子检测(Olink平台、Isoplexis平台、luminex平台、Ella平台)、RNA原位杂交(RNAscope平台)、多色荧光免疫组化实验、共聚焦显微成像、组织样本病理检测等全流程实验服务。
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