号外号外:沃特世新发布的基于机器学习原理用于预测化合物CCS值的MicroApp软件CCSondemand限时免费啦!快快扫描下方二维码,报名申请吧!
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有的小伙伴不禁要问,什么是CCS值?它和高分辨质谱有什么关系?它有什么用?这款CCS预测软件有什么特点?不要急,小编这就给大家科普一下!
什么是CCS?它有什么用?
要说CCS (Collision Cross-Section),碰撞横截面积,必须先介绍下离子淌度技术。传统质谱仪是根据m/z分离组分,而带离子淌度的质谱如Waters SYNAPT XS,SELECT SERIES Cyclic IMS等,可以根据待测离子的大小、形状和电荷等进行多一维的分离。离子淌度的作用是什么?简单来说:
多一维的分离,增加峰容量&缩短分析时间;
降低谱图复杂性;
增加CCS值,更多一个维度的化合物确证;
分离结构类似物或同分异构体;
多重碎裂模式;
......
在分析中运用离子淌度技术,能帮助科学家对复杂混合物或复杂分子进行表征和结构鉴定,有效提高结果的可靠性。想要了解关于“离子淌度技术”的更多基础知识,可参见 “Say Yes To IMS,就是现在”!
“测定化合物CCS值,更多一个维度进行化合物确证”是离子淌度质谱的重要功能之一。CCS是区分气相中离子的一项重要特征,与离子的化学结构和三维构象有关。CCS测量不受样品基质影响,不像色谱,保留时间会随样品基质变化而变化。即使是使用不同仪器和各种色谱实验条件,CCS测量值仍然能保持一致。CCS可用作为化合物的特征参数,有助于分析人员确认分析物鉴定结果或研究其结构。因此,CCS是建立数据库的理想参数。
高分辨质谱作为未知化合物鉴定的特色工具,兼具了离子淌度技术,可获得化合物的CCS值,将更加有助于科学研究人员对未知领域的开拓与深入研究。去深入解读未知物“是什么?有多少?在哪里?”。
CCS值预测软件,它的特点和用途?
自从2006年沃特世推出全 球首台离子淌度商品化高分辨质谱SYNAPT HDMS后,随着离子淌度技术的不断提升和普及,科学家们测定并发表出来的化合物CCS值数量和种类越来越多。作为化合物在一定状态下的固有属性,科学家们也希望将CCS值作为鉴定未知化合物的确认参数之一,以便让鉴定结构更准确。也逐渐有些数据库中添加进去了实测化合物的CCS值,如沃特世现有的代谢物CCS数据库、脂质组学CCS数据库、天然产物CCS数据库、E&LCCS数据库、FDA批准药物CCS数据库等包含CCS实测值的数据库等。现阶段,其中大部分数据库对沃特世客户均免费开放使用,可扫描文初二维码报名申请。
随着越来越多的科学家认识到CCS值的重要性,在代谢组学、脂质组学、天然产品研究、未知物的筛查(如农兽残、E&L、非法添加等)等领域也开始有方案推出。但同时,科学家们也意识到只靠实际测定值在化合物数量上的局限性,也有已发表的文章研究使用AI机器去学习通过对化合物结构的模拟、其他理化属性关系、及已测定的化合物CCS值,来建立模型,实现对未知化合物CCS值的预测。
沃特世作为离子淌度—质谱联用技术的主要开拓者之一,以其雄厚、持久、全面的科技创新能力,始终是该前沿分析技术的领跑者。科学研究团队通过机器学习,对模型不断优化和训练,推出了CCSondemond这款MicroAPP软件,可一次性批量预测多个化合物的CCS值。
CCSondemond会对谁有帮助?
CCSondemand软件也是沃特世通过与客户的合作所收获的成果,并在客户的尝试使用建议中实现提升。已有尝鲜客户获得如下成果:
发表文章
Application of Predicted Collisional Cross Section to Metabolome Databases to Probabilistically Describe the Current and Future Ion Mobility Mass Spectrometry.
doi: 10.1021/jasms.0c00375.
Investigation into Small Molecule Isomeric Glucuronide Metabolite Differentiation Using In Silico and Experimental Collision Cross-Section Values.
doi: 10.1021/jasms.0c00427.
已有应用纪要
使用来自不同仪器平台的预测和实测CCS值,在SELECT SERIES Cyclic IMS上进行异构体分离
碰撞截面CCS预测工具性能考察与评估
哪些客户关注
使用高分辨质谱的客户,特别是离子淌度质谱高分辨的客户:
各种组学研究(如代谢组学、脂质组学等)
未知化合物结构鉴定和研究(如天然产品、代谢物鉴定等)
各领域的筛查研究(如非法添加、农兽残测定、E&L等)
上述研究方向的客户,如果您对离子淌度技术感兴趣,需要CCS值,可以与我们联系噢!扫描下方二维码,选择您需要的数据库,限时免费进行中!速来领取吧~
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