如果严格鉴定细菌菌株的分类地位的话,需要采用多相分类法,从多个角度,运用多种不同原理的方法技术对菌株进行分析,综合判定。
常规步骤有三:
1、形态鉴定:个体形态、群体形态、革兰氏染色、基本结构、特殊结构等等,一般只能进行一些初步的分类判定。形态鉴定 是真菌鉴定中的重要依据,在细菌鉴定里面重要性相对较低。
2、分子鉴定:提取纯菌的DNA样品,对16SrDNA进行扩增,测序,将测序结果在NCBI网站上进行BLAST,可初步确定至“属”一级分类单元。
3、理化分析:进行碳氮源利用、产酶特性、代谢产物等鉴定特征的检测,检测项目需要根据前两项分析的结果,结合《伯杰氏系统细菌学手册》进行。一般需要检测至少20项以上的理化指标,多者可达100项以上。一般可鉴定至“种”一级分类单元。
如果以上三步仍然不能确定该菌株的分类地位,则需要进行更深入的分析,例如DNA杂交、化学成分分析等,必要的时候可以进行全序列测定。
建议参考《伯杰氏系统细菌学手册》或者东秀珠老师编著的《常见细菌系统鉴定手册》。另外一般的教学或者验证性试验,可查询普通微生物学实验手册即可。