蓝藻:含叶绿素a,无叶绿素b,含数种叶黄素和胡萝卜素,还含有藻胆素(是藻红素、藻蓝素和别藻蓝素的总称).蓝藻虽无叶绿体,但在电镜下可见细胞质中有很多光合膜,叫类囊体,各种光合色素均附于其上,光合作用过程在此进行.
绿藻:绿藻植物的细胞与高等植物相似,也有细胞核和叶绿体,有相似的色素、贮藏养分及细胞壁的成分.色素中以叶绿素a和bZ多,还有叶黄素和胡萝卜素,故呈绿色.
褐藻:光合器是载色体,1至多数,粒状或小盘状,含叶绿素a和c、胡萝卜素及数种叶黄素(主要是墨角藻黄素).由于叶黄素的含量超过别的色素,故藻体呈黄褐色或深褐色.