请先弄清楚,DNA的体外复制和体内复制并不是完全相同的两个概念。严格上来说,DNA聚合酶开始合成DNA并不一定需要特定的引物,它所需要的是3‘的羟基末端。在体内,DNA复制时是由特殊的复制起始复合体去识别DNA的复制起始位点,然后合成一小段RNA,接着由DNA聚合酶去识别这一小段RNA并在其3’羟基末端添加新的核苷酸开始合成DNA。对于体外复制,也就是通常说的PCR,PCR系统中是没有一个特定的起始复合体去识别特定的起始序列的,这种情况下,起始的特异性实际上是由人工合成的一小段单链寡聚DNA来承担的,也就是我们说的引物,在PCR反应中,寡聚DNA引物通过碱基互补配对原则来和原始的DNA模板结合,然后提供3‘羟基末端供DNA聚合酶来识别,接着完成DNA的聚合。