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DNA实验室常用的DNA提取方法有哪些?

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DNA实验室常用的DNA提取方法有Chelex100法、有机法、磁珠法、盐析法、NaOH法等,本文详细介绍这些方法。


(一)Chelex100法 

原理:Chelex100是一种螯合树脂,由苯乙烯、二乙烯苯共聚体组成,含有成对的亚氨基二乙酸盐离子,起着螯合基团作用,对多价金属离子有极强亲和力。在低离子强度、碱性及100℃煮沸条件下,可以使细胞膜裂解,并使与DNA结合的蛋白质变性,DNA游离。检材基质中一般含有大量金属离子,在低离子强度及加热条件下,金属离子可以辅助脱氧核糖核酸酶降解DNA,也可以YZPCR反应,所以在提取DNA时,加入Chelex100,螯合了金属离子,防止了DNA降解,提高了PCR扩增成功率。

   

方法:剪取适量血斑、精斑、汗斑、鼻涕斑、指甲、毛根、软组织等等生物检材,置于0.5ml离心管内,加入适量纯水,室温浸泡,13,000rpm离心5min,上清丢弃,管底留约20μl左右液体及检材基质,加入100-200μl 5%Chelex100(有时需加适量PK)56℃15min至数10小时不等,100℃8min,13,000rpm离心5mim,上清备用。


(二)有机法 

原理:有机法提取DNA一般是指用平衡酚(又叫饱和酚)、氯仿等按不同比例混合,采用不同方法提取DNA。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂,蛋白质分子表面带有亲水性基因,很容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能够顺利地进入到水溶液中,形成稳定的胶体溶液。在有机溶剂存在的情况下,破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性,使蛋白质变性沉淀,离心后,有机溶剂于试管底层(有机相),DNA继续稳定的存在于上层水相,蛋白质沉淀存在于两相之间。水相中的DNA在大量冷无水乙醇及单价阳离子存在的情况下,水会溶于乙醇中,而DNA从水相中析出,沉淀,通过离心回收。

 

方法:剪取适量检材,置于0.5ml离心管内,清洗方法同用Chelex100法提取DNA,加入适量纯水及终浓度为100μg/ml PK,37℃-56℃孵育15min至数10小时,有时间隔一段时间补加适量PK → 13,000rpm 5min → 吸上清于另一管 → 加入等体积平衡酚 → 振荡或颠倒彻底混匀 → 13,000rpm 5min →吸上清水相于另一管,加入等体积1:1混合平衡酚:氯仿 → 振荡或颠倒彻底混匀 → 13,000rpm 5min → 吸上清水相于另一管 →加入等体积氯仿 → 振荡或颠倒彻底混匀 → 13,000rpm 5min → 吸上清水相于另一管 →加入2.5倍体积冷无水乙醇冷冻保存10min以上 → 13,000rpm 5-10min → 弃上清 → 室温凉干或100℃ 5min烤干 → 加入10-20μl纯水 → 室温溶解或100℃5min帮助溶解 → 离心上清备用


(三)磁珠法 

原理:(异)硫氰酸胍(GuSCN)是强烈蛋白变性剂,不破坏蛋白质一级结构,能破坏细胞膜及核膜蛋白,并使核酸酶失活,释放DNA。磁珠可以特异性吸附DNA,与DNA结构及片段大小无关。通过洗涤液洗涤,在仅留有特异吸附DNA的磁珠中加入洗脱液,65℃解离后,DNA释放于洗脱液中。 


方法:5%Chelex100提取DNA上清液或者用裂解液直接提取骨骼、指甲、毛发DNA上清液等约移于0.5ml离心管内 → 加入结合液100ul,磁珠5ul  → 振荡混匀,室温5min → 在磁架上吸弃上清 → 加入洗涤液I 300ul → 振荡混匀 → 在磁架上吸弃上清 → 加入洗涤液II 300ul→ 振荡混匀 → 在磁架上吸弃上清 → 加入洗涤液II 300ul → 室温放置2 min干燥 → 加入30-50μl 洗脱液,振荡混匀 → 65℃ 10min → 速于磁架上吸上清于另一新离心管内,备用。


(四)盐析法 

1988年Miller等报导经典盐析法提取血液DNA,其方法为溶解红细胞后,离心沉渣用PK消化,用大约6M饱和NaCl沉淀蛋白质,离心上清中DNA用无水乙醇沉淀,用TE溶解。


(五)NaOH法

原理:强碱溶解、变性蛋白质,破坏细胞膜及核膜,变性核酸酶,释放DNA,NaOH不破坏DNA一级结构。

 

方法: 

1、试剂配制 裂解buffer  0.2M NaOH 中和buffer   0.04M Tris-HCL pH7.5  2、实验步骤 5μl或1×1mm血斑 → 加入450μl纯水 → 室温或37℃15-30min → 13,000rpm 5min → 弃上清 → 沉淀中加入20μl 0.2M NaOH(全血室温5min血斑75℃5min) → 加入180μl 0.04M Tris-HCL pH7.5 → 振荡混匀,离心上清备用。




2018-04-19浏览次数:24395次
本文来源:https://m.yiqi.com/retiao/detail_1913.html
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