细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、16S和23S rRNA。16SrRNA为核糖体的RNA的一个亚基,16SrDNA就是编码该亚基的基因。16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性,成为细菌分类学研究的“分子钟”,素有“细菌化石”之称。16S rDNA基因全长1542 bp,由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系,而可变区则表明物种间的差异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关。
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