流式细胞仪488和640分别激发的pe cy7和apc cy7可以同时用吗

这取决于你流式仪器的型号。先说一下这两种荧光素的原理：这两种荧光素都属于tandem dye。和单体荧光素不同。单体荧光素被激发后，释放出波长较长，能量较低的光线。而这种Tandem dye被激活后，比如PE-Cy7，PE发出的光线并没有离开分子，其能量被共价结合的Cy7吸收，释放出比PE释放光波长更长的光线。目的就是使释放光和激发光的差别更大。
大多数的流式细胞仪，不同的激光位于不同的水平上，所以细胞是在不同时间通过不同的激光，这个时间差在流式的术语上叫做laser delay。通过校准这个时间差，不同激光所激发的信号可以被同时分析。因为PE-Cy7和APC-Cy7是被不同激光激发的，所以尽管留着的释放光一样，在大多数的流式仪器上是可以同时使用的。有一个例外，如果这个仪器的激光是同轴排列的，那就不能同时使用不同激光激发，但释放光一样的荧光素。因为，没有了时间差，机器无法区分同样的光子是来源于哪个激光所激发。