如何从转录组测序结果中获取一个基因的序列

转录本是一个基因序列通过一种剪切后所得的能RNA.以前说转录本都是说表达蛋白的.现在LncRNA的研究多了，也说是一个转录本了.还有没有参考基因组序列的，一般是不可能去GO功能注释的.因为去功能注释的时候要有一个背景.