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不准确为什么基因测序的结果一般会认为序列两端不

yj7bq6 2017-04-03
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sijie199396
不准确为什么基因测序的结果一般会认为序列两端不
是有参考基因组的还是de novo的结果,如果有参考基因组的,那么可以通过这个基因名称在注释结果中查找是否有这个基因,序列信息需要在参考基因组中查找,如果是没有参考基因组的,那么拼接结果是一个fasta格式的文件,可以用blast软件进行比对。
克隆出来基因序列并测序之后,通常先要鉴定这个序列是不是符合我们要求的,通常用生物信息学的方法,去ncbi做一个blastx,通过比对结果来判断这个序列是什么基因,此外,blastx结果会给出比对的方向,很容易就可以判定你测序的那条序列是正向的还是反向的,如果是反向的,那么就需要把它进行互补翻转,就得到了编码氨基酸的有义链了,许多软件都可以实现互补翻转的,如editseq,dnaman等.
8 0 2017-04-04 0条评论 回复
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