深度测序的主要软件有哪些？华大基因测序的结果一般要怎么处理？

主要有两类，一类是基于overlap graph的组装软件，有CABOG、ARACHNE、RePS、phrap及newbler等； 另一类是基于de bruijn graph的组装软件，有SOAPdenovo、Velvet、ALLPATHS、ABySS等。

说的华大基因测序的主要分析方法要看您做什么了。。。高通量测序现在国内做的人多了去了，如果被人店大欺客的话，可以找我们