因本人不是学质谱出身,现委托外单位做了LTQ质谱,发来报告后(是RAW,只有原始数据),不会写文章(方法学部分),想请高手帮忙找一篇跟此方法用的一模一样方法的文献。我的步骤为:... 因本人不是学质谱出身,现委托外单位做了LTQ质谱,发来报告后(是RAW,只有原始数据),不会写文章(方法学部分),想请高手帮忙找一篇跟此方法用的一模一样方法的文献。
我的步骤为:将动物组织样品裂解,跑SDS-PAGE电泳,考染,切下70kd分子量附近的一段(因为想鉴定的某蛋白是这个大小),酶解成肽段,上机(仪器为Thermo LTQ-Orbitrap),出来的数据跟想鉴定的蛋白的氨基酸序列比对,发现组织中含有该蛋白。下图是报告中的图
还有一堆字母可能代表氨基酸,还有一堆这样的图
谢谢各位我就这么点分了,,,如果还不清楚请留下QQ,,,,谢谢您的关注
上面的图代表蛋白的序列覆盖率,即实际测到的氨基酸序列占蛋白全序列的部分。
下面的图代表肽段的二级谱图与其序列的匹配情况,带标注的峰越多,说明匹配越好。
详细方法可参考以下文献。DOI: 10.1021/pr200019m