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手工法 革兰阴性菌总DNA提取模板做PCR 经验方法

任桓铭 2010-01-19
我要提细菌模板做数个基因的PCR,目的基因1kb左右,有些在基因组上,有些在质粒上。各位实验室有没有经验的手工法提细菌总DNA的方法?介绍一下吧,要切实可行的,谢谢另外有一批菌需要... 我要提细菌模板做数个基因的PCR,目的基因1kb左右,有些在基因组上,有些在质粒上。 各位实验室有没有经验的手工法提细菌总DNA的方法?介绍一下吧,要切实可行的,谢谢 另外有一批菌需要提质粒做PCR,经验的手工提取方法也请不吝赐教~ 菌株数量上百,请以方便易批量操作的方法优先 模板纯度不要求高
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heitiansh1
质粒的方法就溶液123的方法就可以了

DNA可以参考提取动物、植物DNA的方法

更快速的方法可以参考我们做菌落pcr的方法,这个方法是采用少量的菌作为模板
然后加入pcr反应液,在pcr高温预变性的过程中菌细胞壁会裂解掉,dna和质粒都释放到溶液中作为模板参与扩增。

如果你有96孔深板(1-2ml)以及排枪Z好了,省事省时。牙签或者枪头挑菌挑一点点(只要沾到菌落就行,不要求大块,大块反而不好),96孔每孔加500ul培养液,挑96个,然后拿去摇菌,培养3-5小时,菌液就可以直接作为pcr的模板了。
只要引物好用,基本都可以扩出来的。我们鉴定阳性克隆都这样做,
你可以参考
2 0 2010-01-20 0条评论 回复
焰影目
我们实验室做批量DNA提取,一次都是144个,我们主要用的是氯酚仿法进行提取~浓度测出来都能上千,有的甚至有2000~3000,我们是用于做snpshot的,所以要求纯度还是很高的。A260/A230要求在1.8以上。判型上做四版(每版96孔样),几乎全做出来,偶尔一个两个,也无需重做(统计学意义上是足够了),所以建议使用氯酚访法提取。
11 0 2010-01-20 0条评论 回复
baby墨情86
如果你仅仅是为了PCR验证,而不是需要抽取基因组或者质粒的话:

1 模板在质粒上的:直接做菌液PCR,不用抽提模板。

2 模板在基因组上的:沸水煮10min,冻融一次,12000rpm 5min,去上清做PCR。

OK。
13 0 2010-01-20 0条评论 回复
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