PCR扩增仪与DNA合成仪一样吗

看设备吧。我用的Applied Biosystem的thermal cycler是可以既做cDNA synthesis 又做qPCR反应的。但是之前用的Biorad的thermal cycler就只能做cDNA synthesis 和普通的PCR （不能定量）。
你主要要理解这两个反应的原理是什么，再看一下设备型号和说明书就知道了。
总的来说，这个所谓的扩增仪和合成仪本质上都只是一个控温加热器。所以在不要求定量的条件下，设定好加热控温程序，thermal cycler是都可以做的。但是做qPCR的仪器除了控温，还要有荧光检测（激光）装置，所以相应的仪器体积（包括激光扫描和防辐射外壳等）都比只能做普通PCR和cDNA合成的仪器要大很多。
希望回答了你的疑问。

不一样

不一样。

若不特殊指出，一般认为
PCR仪：利用DNA聚合酶对特定基因做体外扩增的仪器（生物酶反应）
DNA合成仪：利用化学的方法，用于合成结构上类似DNA或RNA的寡核苷酸的自动化仪器（化学反应）