500多氨基酸的蛋白，突变两个氨基酸对其活性有影响么

不一定有影响，要看这两个氨基酸是否组成这个蛋白质的活性基团，如果组成活性基团则对该蛋白质功能有影响，若远离活性基团则影响较小或无影响。