housekeeping gene的引物设计与你想探测的目标基因引物设计方法相同,而且一般文献上都应该给出,遵照文献使用即可,一般问题都会出在目标基因的引物设计上。不过在q-PCR中,housekeeping gene 引物还需注意以下几点
1. 首先找到合适的housekeeping gene,其表达应具有一致可参考性。
2. 引物长度在17-22bp。
3. 引物退火温度在57°-60°之间,并且各个引物之间的退火温度差异不能超过1°。
4. 引物所扩增基因的大小在50-400bp间,通常不超过200bp为宜。
5. 引物本身无自身折叠,或者两引物之间互补的情况存在。
6. 引物设计所扩增的目标基因,Z好是跨越两段外显子的区域,这保证引物所扩增的基因,全部来自mRNA转化的cDNA,而非基因组DNA。