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超纯水设备中，离子交换树脂很重要，它的性能与水电阻率、电导率、水中各种阴阳离子数有直接关系。因此，离子交换树脂的保养很重要。
首先，超纯水设备中离子交换树脂的贮存。离子交换树脂含有一定水份，贮存时，不宜露天存放，储运过程中应保持湿润，以免风干脱水，使树脂破碎，如贮存过程中树脂脱水了，应先用浓食盐水（10%）浸泡，再逐渐稀释，不得直接放入水中，以免树脂急剧膨胀而破碎，而影响树脂性能。同时，贮存温度因保持在5-40℃，避免过冷或过热，影响质量，若冬季没有保温设备时，可将树脂贮存在食盐水中，食盐水浓度可根据气温而定。
其次，超纯水设备中离子交换树脂的清洗。在树脂生产或使用过程中，可能吸收到铁、铅、铜等无机杂质（主要铁锈）。当树脂接触到水、酸、碱或其它溶液（如酒精，双氧水等）时会溶于其中。此外，反应过的树脂，可以用相应的酸或碱或盐溶液与反应，使树脂恢复离子交换活力，其中不同类型的树脂，用的溶液略有不同。
Z后，超纯水设备中的离子交换树脂是有机物，因此油污、有机分子、微生物等对它有损害作用，因此在离子交换树脂处理水之前，对水进行预处理，去除水中的油污等。一般来说，酸性树脂防金属，可以用4-5%的稀盐酸浸泡；碱性树脂防有机物污染，可用10%NaC1+2-5%NaOH混合溶液浸泡或淋洗到中性，必要时可用1%双氧水溶液泡数分钟，其它，也可采用酸碱交替处理法，漂白处理法，酒精处理及各种灭菌法等等。
另外，在超纯水设备或超纯水机在使用过程中，注意检测水的电阻率、电导率，条件充许的情况下，可以检测水中离子的含量是否在正常范围之内。
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