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Rubicon和Qiagen单细胞全基因组扩增试剂盒的对比

专业评测

一、

 

品牌

Rubicon

Qiagen

产品

PicoPLEXWGAKit

单细胞全基因组扩增试剂盒

REPLI-gSingle Cell Kit 

单细胞全基因组扩增试剂盒

技术

特殊随机引物起始的热循环扩增+PCR

多重置换扩增(MDA)

表现

中等基因组覆盖度中等保真度

低基因丢失率Zgao的重复性和一致性

高基因组覆盖度高保真度

高基因丢失率低重复性和一致性

Z佳应用

基因拷贝数变异(CNV)

单核苷酸变异(SNV)

操作细节

反应时间

3小时

超过8小时

扩增DNA产量

2-5µg2

7-20µg1,40µg3

产物长度

0.25–1.0kb1

平均长度>10kb3

 

参考:

1.Thecomparisonoftheperformanceoffourwholegenomeamplificationkitsonionprotonplatformincopynumbervariationdetection. XinyiZhang etal.

2.Rubicon资料,RB3050说明书.

3.Qiagen资料,150343说明书.

 

二、产品介绍

RubiconPicoPLEXWGAKit单细胞全基因组扩增试剂盒

单管,3步,PicoPlEXWGA试剂盒专门用于人单细胞和pg级DNA的扩增,具有可重复性、低背景的特点。3小时内完成细胞裂解、热循环文库制备和低背景扩增,Z终能得到2-5µg扩增DNA。

 

技术原理及特点

利用特殊随机引物(Quasi-randomprimer)引发线性扩增进行全基因组扩增。

相比于以往的PCR、MDA、MALBC为基础的单细胞全基因组扩增技术,操作简单快速。扩增Zda优势:再现性良好。

 

 

REPLI-gSingle Cell Kit 单细胞扩增试剂盒

REPLI-gSingle Cell Kit 单细胞扩增试剂盒采用MDA技术,可均一的扩增单个细胞(1至1000个细菌或肿瘤细胞)或纯化的基因组DNA,能够覆盖基因组所有位点。产量稳定,可达40µg(产物平均长度大于>10kb)。适用于二代测序等新技术应用。可用于癌症、干细胞或宏观基因组学(metagenomics)研究。

 

技术原理及特点

REPLI-gSingle Cell Kit 单细胞扩增试剂盒采用多重置换扩增(MDA,MultipleDisplacementAmplification)技术,对所有基因组位点进行无偏差的扩增。与基于PCR的全基因组扩增技术相比,该技术具有更好的扩增保真度,避免出现假阳性或假阴性信号。

 

多重置换扩增(MDA)的恒温基因组扩增技术包含了随机六聚体与变性DNA的结合过程,以及使用Phi29聚合酶在恒定温度下进行的链置换合成过程。典型扩增能够生成40µg以上的DNA产量,而不受起始模板量影响,这意味着在大多数应用中无需进行额外的DNA浓度检测,既可直接进行后续的遗传学分析。

 

温和的碱变性法

REPLI-gKit采用温和碱性孵育法,在DNA断裂或去碱基化发生频率非常低的情况下让使其均匀地变性。这样扩增得到的DNA具有非常高的完整性,扩增片段的长度达到Zda化,从而使基因组中的位点和序列都得以均匀呈递。

 

订购信息

品牌

货号

产品名称

包装

Rubicon

RB3050/R30050

 PicoPLEXWGAKit单细胞全基因组扩增试剂盒,arrayCGH、PCR分析用

50次反应

QIAGEN

150343

REPLI-gSingle Cell Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒

24次/盒

 

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2004-08-13
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