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转基因农产品的检测，就是检测农产品中有否外源基因，实质上是检测启动子、终止子、标记基因片断、目的基因片断、外源基因转录产物的丰度等。就方法而言，分为基因水平的检测（各种PCR定性、定量方法和基因芯片技术）和基因转录水平检测（酶联免疫吸附反应技术、蛋白芯片技术以及Southen杂交Westen印迹法等），主要使用仪器按检测程序分3部份：
（1）用于DNA样品制备的仪器设备：试剂盒、离心机、振荡器等；
（2）用于基因扩增的仪器设备：PCR仪、混合液，保真DNA聚合酶等；
（3）分离、分析、检定的仪器设备：电泳系统、成像分析系统、核酸（蛋白）测定仪、酶标仪、洗板机、定量PCR仪等。
这些仪器设备国外主要厂家BI0-RAD、Thermo-LifeSciences、GE等；国内虽尚无完整生产上述仪器的厂家，但上海的天能、天美、三科、新芝，杭州的郎基、博日，北京的六一等各生产上述部份仪器。
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