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根据生物安全防护水平的差异，生物安全柜可分为一级、二级和三级三种类型。一级生物安全柜可保护工作人员和环境而不保护样品。其气流原理和实验室通风橱基本相同，不同之处在于排气口安装有HEPA过滤器，将外排气流过滤进而防止微生物气溶胶扩散造成污染。一级生物安全柜本身无风机，依赖外接通风管中的风机带动气流，由于不能保护柜内产品，目前已较少使用。
二级生物安全柜是目前应用Z为广泛的柜型。按照《中华人民共和国医药行业标准YY0569-2005生物安全柜》中的规定，二级生物安全柜依照入口气流风速、排气方式和循环方式可分为4个级别：A1型，A2型，B1型和B2型。所有的二级生物安全柜都可提供工作人员、环境和产品的保护。
A1型安全柜前窗气流速度Z小量或测量平均值应至少为0.38m/s。无内部循环气流，1**%的气体通过排气口过滤排出。
A2型安全柜前窗气流速度Z小量或测量平均值应至少为0.5m/s。70%气体通过HEPA过滤器再循环至工作区，30%的气体通过排气口过滤排出。
二级B型生物安全柜均为连接排气系统的安全柜。连接安全柜排气导管的风机连接紧急供应电源，目的在断电下仍可保持安全柜负压，以免危险气体泄漏如实验室。其前窗气流速度Z小量或测量平均值应至少为0.5m/s(100fpm)。
B1型70%气体通过排气口HEPA过滤器排除，30%的气体通过供气口HEPA过滤器再循环至工作区。
B2型为1**%全排型安全柜，无内部循环气流，可同时提供生物性和化学性的安全控制，可以操作挥发性化学品和挥发性核放射物作为添加剂的微生物实验。
三级生物安全柜是为生物安全防护等级为4级实验室而设计的，柜体完全气密，工作人员通过连接在柜体的手套进行操作，俗称手套箱(Golvebox)，试验品通过双门的传递箱进出安全柜以确保不受污染，适用于高风险的生物试验，如进行SARS、埃博拉病毒相关实验等。
根据生物安全柜的强制性行业标准《中华人民共和国医药行业标准YY0569-2005生物安全柜》规定，只有获得国家食品药品监督管理局颁发的三类YL器械注册证的产品才能真正保护操作人员、实验室环境和操作样本。
生物安全柜广泛应用在YL卫生、疾病预防与控制、食品卫生、生物制药，环境监测以及各类生物实验室等领域，是保障生物安全和环境安全的重要基础，属于“民生"计量的范畴。早在30年前，生物安全柜检测已经在国外开展，目前主要依据欧盟或美国的标准。在国内，目前还没有统一的生物安全柜检测国家标准，生物安全柜检测方法十分混乱，既有建设部的标准，又有药监局的标准，还有采用欧盟标准、美国标准或各生产厂的企业标准的。
生物安全柜检测现行的主要标准依据有：
(1)欧盟EN 12469：2000《Biotechnology-Peformance Criteria for Microbiological Safety Cabinets》
(2)美国NSF/ANSI 49—2002《Class II(Laminar Flow) Biosafety Cabinetry》；
(3)JG 170-2005中华人民共和国建筑工业行业标准《生物安全柜》；
(4)YY 0569-2005中华人民共和国医药行业标准《生物安全柜》。
鉴于生物安全柜危险的使用环境，在安装时以及以后每隔一定时间，要由国家空调设备质量监督检验ZX的专业人员按照规定对每一台生物安全柜的整体运行性能进行性能检测，以检查其是否符合国家及国际的性能标准保证使用者的安全。生物安全柜检测主要包括物理学检测和生物学检测两个方面，根据检测性质可分为首次检测、后续检测。 除生物安全柜的一年一度的常规检测外，下列情况之一时，如安装后、移动后、检修后、更换过滤器后，也必须进行现场生物安全柜检测。
生物安全柜-安全水平生物安全柜的选择需要根据所涉及微生物试验品或产品的致命性，传播媒介等因素，这些因素可划分为一至四级生物安全水平(BSL)：
生物安全水平 致命性 媒介 可治愈性 范例
BSL-1 无或极低 液体 可以 BS*
BSL-2 一般 液体 可以 HIV
BSL-3 高 空气 可以 TBC
BSL-4 极高 空气 不可 Ebola
* Bacillus subtilis (草芽孢杆菌)
被分类为生物安全水平一级和二级的微生物试验品或产品不会产生气溶胶，因此在开放的实验台面上开展工作；而对于一些可能涉及或者产生有害生物物质的操作过程都应该在生物安全柜内进行，在这些条件下Z好使用二级的生物安全柜。二级生物安全水平的试验品或产品是可以通过液体传播，所以操作人员必须对于污染的锐器要特别注意。客户在选购安全柜时，也因注意确保没有突出的锐角，在使用时也需要每天清理工作台面。
在三级生物安全水平的生物实验室中，所有与传染源操作有关的步骤，都在二级或者三级生物安全柜中进行，并由穿戴合适防护服的实验人员进行；对于四级生物安全水平，所有工作应限制在三级生物安全柜中；假若在二级生物安全柜中进行，必须使用装备生命支持系统的一体正压防护服。值得特别注意的是，当出现新型不明微生物时，也必须在四级生物安全防护实验室中进行。待有充分数据后再决定此种微生物或毒素应在四级还是在较低级别的实验室中处理。
生物安全柜-注意事项操作者
生物安全柜如果使用不当，其防护作用就可能大大受到影响。
紫外灯
生物安全柜中不需要紫外灯。如果使用紫外灯的话，应该每周进行清洁，以除去可能影响其杀菌效果的灰尘和污垢。
明火 在生物安全柜内所形成的几乎没有微生物的环境中，应避免使用明火。
溢出
实验室中要张贴如何处理溢出物的实验室操作规则，每一位使用实验室的成员都要阅读并理解这些规程。
认证
在安装时以及每隔一定时间以后，应由有资质的专业人员按照生产商的说明对每一台生物安全柜的运行性能以及完整性进行认证，以检查其是否符合国家及国际的性能标准。
清洁和消毒
由于剩余的培养基可能会使微生物生长繁殖，因此在实验结束时，包括仪器设备在内的生物安全柜里的所有物品都应清除表面污染，并移出安全柜。
清除污染
生物安全柜在移动以及更换过滤器之前，必须清除污染。
个体防护装备
在使用生物安全柜时应穿着个体防护服。
警报器
可以在两种警报器中选择一种来装备生物安全柜。
优点
《实验室生物安全手册》提出，生物安全柜可以有效减少由于气溶胶暴露所造成的实验室感染以及培养物交叉污染。生物安全柜同时也能保护工作环境。
事实上，生物安全柜更侧重于保护操作人员和环境，防止操作的病原微生物扩散造成人员伤害和环境污染。
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