SNP功能研究进展-多功能混合器技术文章
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SNP研究目前仍可谓如火如荼,一方面是主要数据库可以轻松检索几乎任何基因的 SNP 分布和频率。另一方面,SNP的功能研究具有非常大的研究空间和前景。这应该归因于许多 SNP 的流行病学关联研究的可重复性较差。从功能上解释它是为了解决根本问题。
目前SNP功能研究主要包括以下几个方面:
1.报告基因转染技术:该技术主要用于启动子SNP对mRNA转录效率的研究,是通过观察转录结果来判断该SNP是否具有功能。
2. EMSA技术:通过体外合成含有SNP位点的寡核苷酸和转录因子的特异性结合来观察结合强度和效率,但该技术只是人工合成的较短长度的寡核苷酸,没有考虑周围遗传背景环境的影响SNP,因此它们的再现性和说服力不强。
3. ChiP技术:该技术利用超声波对染色体进行片段化,然后将片段化的核酸与转录因子结合,然后观察判断结合效率和强度,该技术克服了EMSA的一些缺点,目前已有很多文献做。
转自生命科学论坛
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2007-07-08