在现代分子系统学研究中,Zda似然法和贝叶斯分析是两种文献中Z为主要的构建系统发育树的两种方法。在构建系统发育树之前,研究人员一般都需要对比对后的多条基因序列进行Zyou进化模型选择。目前,通常使用的模型选择软件,如ModelTest等,其实包含似然比检验(LRT)、赤池信息标准(AIC)和贝叶斯信息标准(BIC)等多种选择模型的统计标准。对于研究者来说,具体采用哪种统计标准Z后选出进化模型往往是一个让人困惑的问题。因此,为了更好地理解不同选择标准的行为特点,从而方便众多研究者的应用,新研究针对广义时间可逆模型(GTR)中24个基本的模式,共计模拟了33600个数据。就分层似然比检验(hLRT)、赤池信息标准(AIC)、贝斯信息标准(BIC)和决定理论(DT)等四种现有的主要标准,分别对这些数据进行模型选择,并继而分析了不同标准的准确性、精确性、差异度和选择偏向性。结果表明,BIC和DT具有较高的准确性和精确性,因此判断它们是目前Z佳模型选择标准。另外,结果显示,对于同样的数据不同的选择标准经常选择出不同的Zyou模型;其中hLRT和AIC的差异度Zgao,而BIC和DT之间的差异度则Z小。选择偏向性结果表明:当真实模型含不变异位点这一参数时,hLRT的选择准确性较差;而BIC和DT则总是呈现相似的选择偏向性。总之,研究表明,在做模型选择分析时,BIC和DT应该作为shou选的统计标准。结合模型适度检验,依据BIC和DT的选择模型理应能促进分子系统及相关研究的可信性。该研究主要由ZG科学院动物研究所朱朝东博士领导的课题组完成,主要得到了ZG科学院农业办公室项目(KSCX2-YW-NF-02)、国家自然科学基金委项目(30870268,J0930004)资助,并部分得到ZG农业部行业科技专项(200803006)、北京市自然科学基金委ZD基金(KZ201010028028)等项目的资助。研究论文已发表在BMCEvolutionayBiology。该论文自发表以来,已经成为该杂志高度受关注论文之一。目前diyi作者罗阿蓉已经得到国家留学基金委资助,前往澳大利亚联邦科工委组织进一步开展博士论文工作,加强在该领域的合作研究。
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2004-11-08