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(1)Ca2+通道相关自身抗体：P／Q或N型Ca2+通道相关自身抗体的阳性结果与神经系统自身免疫一致，并提示患者可能患有肿瘤。这些自身抗体可与ANNA1，ANNA-2或PCA-1共存，除了偶发性小脑共济失调患者和肌萎缩侧索硬化的少数患者外，P／Q型或N型Caz+通道相关抗体见少于3％的健康受试者、其他的自身免疫病患者或神经系统疾病患者中，L型Ca2+通道相关抗体见于75％肌萎缩侧索硬化患者。但是，对这些自身抗体的前瞻性临床实验仍不足，P／Q和(或)N型Ca2+通道相关抗体见于28％的无神经系统疾患的SCLC患者，并且明显好发于缺乏远端转移瘤患者。
LES完全依靠肌电图扫描作诊断，在临床中通常依靠口干、男人勃起无力等Z典型的肌无力症状作出诊断。然而，视觉疲劳能产生MG病的错觉。但少于5％的MG患者有Caz+通道相关自身抗体，而95％的LES患者抗体呈阳性有助于鉴别诊断。分析P／QCa2+通道相关抗体对于区别LES和MG非常有用，电生理学的标准尚无令人信服的MG和LES共存证据，但13％的LES患者有AchR或横纹肌自身抗体。这些患者常常是滥用烟草、伴有复杂的神经症状，如感觉运动或自主运动神经病变或脑病川、脑共济失调等，服用免疫YZ剂的患者Ca2+通道相关抗体可呈阴性。若患者同时患有原发性神经性疾病和(或)肿瘤时，诊断将很困难。
(2)神经细胞核和胞质自身抗体：以冷冻切片基质(小脑、肠和*)提供和周围(肠神经丛)神经元和神经细胞，采用间接免疫荧光法能清晰地鉴定PCA-1(Yo)特异的IgG自身抗体，能区分ANNUl(Hu)和ANN久2(Ri)，也能与非特异抗核抗体相区分。如果在检测前用非神经组织预吸附血清能减少非器官特异性自身抗体的干扰。也可用蛋白质印迹法再次验证，但后者并不能提供更高的敏感性。
神经或肌组织自身抗体可作为诊断神经系统疾病伴发肿瘤(常见的是小细胞型肺癌、乳癌、卵巢癌)的标志。这种患者的肿瘤往往易被忽略，血清或脑脊液内的某些标志性自身抗体的检测(ANNUl，ANNA-2，PCA1，抗两栖动物，P／Q和N型Ca2+通道抗体)提供了有价值的诊断和LX观察指标。乙酰胆碱受体和横纹肌抗体也是原发性肺癌(小细胞癌、腺癌和磷癌)伴发副癌性神经系统疾病有价值的标志物。
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