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首先要确认遵守正确的清洗和处理要求。
反渗透膜系统Z终是需要进行清洗的RO系统表示出污染的倾向、长时间停运之前、或按计划进行惯例保养时，由于RO系统呈现污垢而需要清洗的频率随地点的不同而不同。建议你清洗RO系统。当呈现下列污染特征(规范化后产水量下降10~15%规范化后产水水质下降10~15%或者给水与浓水间的压降增加10~15%)时表明你RO系统需要清洗了。
一般习惯上可接受的清洗频率是3~12个月一次。如果每个月你不得不清洗一次以上，就应该改善RO预处理系统，调整RO系统的运行参数，如果每1~3个月需要清洗一次，则需要在提高当前设备的运行水平上做工作，但是否需要改进预处置系统较难判断。
采用该法可减少反渗透膜清洗次数。设备停运期间用产品水浸泡RO膜组件有助于溶解污垢和松散堆积物，RO设计中通常会忽视使用RO产品水冲洗系统中的污垢。因此降低化学清洗频率。
但往往污染物的存在不止一种，因污垢地点不同所需要清洗掉的污垢物也不同。因此使问题复杂化，罕见的污染物种类有：
碳酸钙垢
硫酸钙、硫酸钡、硫酸锶垢
铁、锰、铝等的金属氧化物
二氧化硅
胶体沉积物(无机或无机/有机混合物)
自然或合成有机物
生物质(生物污泥、霉菌或真菌)
建议与设备制造商、反渗透膜组件制造商、RO系统专用药品供应商联系。一旦辨明污染种类后，有许多因素与选择合适的清洗化学药品和正确的清洗方法有关。头一次进行清洗时。建议采用一种或多种清洗药品。这些药品可能是惯例的可以从许多供应商那里买到也可能是专用清洗液，这种专用清洗液可能更贵一些，但是使用时会更简便，并且这些公司还具有提供技术支持优点。还有一些公司可能提供更有价值的服务;把从你系统中取出的膜组件带回进行试验，从而选择正确的清洗药品和方法。以获得Z佳的清洗效果。比方首先使用低pH值的清洗除去水垢一类的物质，通常需按特定的次第使用各种不同的清洗药品进行清洗。然后使用一种高pH值的清洗液除去有机物。但是有时也会首先使用高pH值的清洗液除去油类污垢，然后再使用一种低pH值的清洗液。有一些清洗液中还添加有洗涤剂，这将有助于清除污染严重的生物和有机杂质。其它清洗添加有像EDTA之类的螯合剂，这些螯合剂有助于清除胶体、有机物、生物杂质和硫酸盐垢。必需记住的是选用不正确的清洗药品或清洗方法不正确时可能会使污垢堵更严重。
选择反渗透膜清洗药品和使用复合聚酰胺膜时有一些注意事项：
遵守制造商建议的药品选择清单、剂量、pH值、温度和接触时间。
使用侵蚀性Z小的药品完成清洗工作。这些做会延长膜的使用寿命。
一定要审慎以延长膜的使用寿命。药品侵蚀性较小的pH值范围是4~10允许的ZdapH值范围是2~12调节pH值时。
完全冲洗系统以排尽上一次的清洗液。加入下一种溶液之前，酸和碱不要混合。。
【超纯水中的热原性质特点】
一、水溶性能溶解于水，其浓缩液往往有乳光
二、体积小热原的大小、形态、化学组成因菌种不同而不同，细菌内素要比细菌小得多。仅1-50nm，类脂A更小，相对分子质量只有几千，所以一般的过滤方法不易去除。
因体积小、质轻，有时甚至在蒸馏时会承受水蒸气的雾逸出到蒸馏水中;
三、热稳定性强细菌内毒素耐热性很。100℃以下无大变化，在120℃高温下加热4小时仅能破坏98%，要完全灭活需在180℃高温下加热两小时以上。这样的去除方法实施起来有相当难度。
四、化学稳定性强一般化学药品不影响细菌内毒素的活性。只有强酸、强碱或强氧化剂(如高锰酸钾或过氧化氢)可以破坏细菌内毒素。
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