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蛋白质组(Proteome)的概念Zxian由MarcWilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein).蛋白质组的概念与基因组的概念有很多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变.在转录时，一个基因能够多种mRNA形式剪接，并且，同一蛋白可能以很多形式进行翻译后的修饰.故一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物，蛋白质组中蛋白质的数目有时能够超过基因组的数目.蛋白质组学(Proteomics)处于早期“发育”状态，这个领域的专家否认它是单纯的方法学，就像基因组学一样，不是一个封闭的、概念化的稳定的知识体系，而是一个领域.
蛋白质组学集中于动态描述基因调节，对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定，鉴定疾病、药物对生命过程的影响，以及解释基因表达调控的机制.作为一门科学，蛋白质组研究并非从零开始，它是已有20多年历史的蛋白质(多肽)谱和基因产物图谱技术的一种延伸.多肽图谱依靠双向电泳(Two-dimensionalgelelectrophoresis,2-DE)和进一步的图象分析；而基因产物图谱依靠多种分离后的分析，如质谱技术、氨基酸组分分析等.
蛋白质芯片，是一种高通量的蛋白功能分析技术，可用于蛋白质表达谱分析。目前已经商品化的生物芯片多为微阵列芯片，而微流路芯片和芯片实验室正处于研究阶段。
蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标Z有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和ZL方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。
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