5个步骤掌握FISH技术:高效探索微生物世界
2024-04-2318荧光原位杂交技术(FISH)是一种强大的分子生物学工具,它允许研究者在保持细胞形态完整的条件下,检测和定位特定微生物群落中的核酸序列。这项技术通过使用带有荧光标签的特异性探针,使得目标微生物在复杂的环境样本中得以可视化。FISH技术的应用范围广泛,包括但不限于生物被膜研究、环境微生物组成分析、以及微生物代谢机制的探究。
FISH技术的实验方法
第一步:准备目标基因对应的探针
在进行FISH实验之前,首先需要设计并合成与目标微生物的特定基因序列互补的探针。这些探针通常带有荧光标签,以便在显微镜下进行可视化。
第二步:探针变性
对于双链DNA探针,需要在实验前进行变性处理,将其转换为单链形式以便与目标序列进行杂交。这一过程通常在70℃-80℃的条件下进行约10分钟,随后迅速冷却以防止探针重新形成双链。
第三步:样品制备
样品的固定是FISH实验中的关键步骤。通常使用4%的多聚甲醛作为固定液,以保持细胞的形态和结构完整性。固定后的样品需要经过一系列的脱水步骤,通常使用50%、80%和100%的乙醇进行处理。
第四步:杂交
在样品脱水后,滴加含探针的杂交液,并在湿盒中进行恒温杂交,时间一般为1-3小时,温度根据探针的设计选择在37-46℃之间。如果需要进行预杂交,可以先使用不含探针的杂交液进行处理,以减少非特异性结合。
第五步:洗脱
杂交完成后,使用预热的清洗液进行漂洗,以去除非特异性杂交的探针。随后使用超纯水清洗并吸干样品,然后进行荧光显微镜下的观察。
一实验小贴士一
FISH-LIFT 工作流程
FISH标记
荧光显微观察
LIFT分选
测序
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