欧盟最大的农业生物科技公司荷兰KeyGene公司,是一家专注于提供基因型-表型分析和性状及关联基因挖掘服务的公司。自从2011年由KeyGene公司和德国LemnaTec共同建立的欧洲植物表型平台PhenoFab投入运转后,迅速积累了大量的基因型-表型测量和分析经验,并取得了异常出色的结果,从而导致PhenoFab一直处于满负荷运转状态。
基于大量的PhenoFab使用经验和数据分析的基础,KeyGene研发出了一款国际上最小的便携式植物表型平台KeyBox。
考虑到KeyBox可能需要经常带到温室、野外或其它地方进行测量,因此它被设计成可快速拆卸、打包的样式。将KeyBox打包后,就成为一个拉杆箱,方便运输和携带。
折叠前 折叠后
技术路线
操作软件
KeyBox的工作软件Pheno-suite由KeyGene公司强大的生物信息学和软件团队开发,充分考虑在实际应用的需求,操作简单,功能强大。
Pheno-suite的工作模块包括:
l基础整合模块。内置在软件中,是软件的基本组成部分。
l选配模块。功能强大,针对应用的每个算法是一个模块,客户可以根据需求选配。
基础整合模块 | 功能强大的选配模块 |
l 颜色校准Color correction l 标签识别Label recognition l 灰度图转换Gray scale conversion | l 生物量测量Biomass detection l 形态大小测量Tomato size l 种子萌发测量Seed germination in tray l 叶片大小测量Leaf size detection KeyGene在不断的研究新算法,新模块出来后可以付费升级。 |
应用实例
1、下图中,利用KeyBox测量了辣椒的像素大小和破损部位的像素大小,这样就得出了辣椒的破损程度。
2、下图中,利用KeyBox测量了甜瓜的像素大小、黑点的像素大小,得出黑点的占比。还测量了甜瓜的圆度。
3、下图中,利用KeyBox测量了一个叶片的尺寸和形态参数。
4、下图中,利用KeyBox测量了一个104孔的芽盘中,种子的萌发情况,精确识别萌发的种子和未萌发的种子,计算出萌发率。
5、下图中,利用KeyBox研究了拟南芥野生型和突变株对霉病的抗性,精确计算出病变部位的像素大小。
主要功能l对植物体进行整株或器官(果实、种子、根系、叶片、幼苗等)的表型成像 l 便携可折叠式设计,方便带到温室或野外使用 l 标准光照环境,数据可重复 l 经验丰富的专家根据应用经验设计的软件,操作简单,解决农业应用中遇到的问题 l 内置颜色校正和读取电子标签的程 l 可选一系列的功能程序模块,并不断升级中 | 应用领域l 表型性状分析/挖掘,基因型-表型关联 l 农业育种 l 园艺学、农业信息学 l 果实品质分析 l 植物病理研究 l 生物量分析 l 种子萌发研究 l 抗逆研究 |
上海泽泉科技股份有限公司
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