疫苗接种场所核酸检测呈阳性?!冷静,也许只是虚惊一场
2021-03-0455852021年1月24日,ZG疾病预防控制ZX(CDC)发布了“关于新冠疫苗接种单位环境标本监测相关工作技术建议”的指导文件。
文件中解释了在新冠疫苗接种单位采集和检测的环境标本中检测到新冠病毒核酸阳性,对疫苗接种和监测工作带来困惑这一情况,并给予了相关的专家技术意见。
意见中指出新冠疫苗接种场所有可能因为疫苗中灭活病毒自带的核酸而造成核酸检测呈阳性,而灭活疫苗中的核酸本身没有活性,并不具备传染性,这种情况就会给相关防疫人员造成一定的困惑,所以在建议中要求:
“如已经开展监测发现阳性,或在疫苗接种场所附近采集的环境样本病毒核酸检测阳性,建议通过病毒全基因组测序的方式,明确核酸是否来自疫苗。”
二代测序技术在新冠疫情中的作用
国家疾控的工作技术建议中提到的测序技术,特别是二代测序技术(NGS)及相关的微生物宏基因组测序(mNGS),在新冠疫情的抗击中也发挥着重要的作用,对于目前Z常用的定量 PCR 技术是非常好的补充,在病毒的突变与溯源中发挥着极其重要的作用。
也正是因为其可以判断出是何种类型的病毒,故可以将某地发生流行的病毒与疫苗的病毒中所带的核酸进行区分,结合其他流行病学手段即可判断是否是疫苗中的病毒核酸引起的环境阳性。
*新冠病毒灭活疫苗中保留的病毒核酸片段已没有活性、不具备感染性
二代测序流程冗长的应对之法
二代测序的一般流程过程非常冗长,也较易出错,Eppendorf 为此专门推出了 epMotion® 5073 和epMotion® 5075 的 NGS 套装,可以自动化完成二代测序文库构建过程中的移液和纯化工作,包括十分让人头疼的 pooling 工作,epMotion 也可以轻松应对。
▲ epMotion® 5073m NGS solution
▲ epMotion® 5075t NGS solution
二代测序流程离不开定性 PCR 仪
定性 PCR 虽然不能直接进行新冠病毒的检测,但是在二代测序的流程中却是离不开定性 PCR 仪进行酶反应孵育和核酸扩增的,在定性 PCR 方面,Eppendorf 有着悠久的历史,在 90 年代发明了梯度 PCR 技术,近年又推出了 2D 梯度功能,极大地提高了 PCR 条件的优化效率,在这次新冠检测中也是被用户认可,用于二代测序文库构建的过程。比如美国的 Ginkgo Bioworks 一次就采购了 100 多台 Mastercycler® X50 用于新冠相关的二代测序项目,来满足美国目前居高不下的检测通量需求。
Mastercycler® X50 系列梯度 PCR 仪
同时该用户还购买了多套 CycleManager X50 软件来对如此之多的 PCR 仪进行集中控制和管理。一套 CycleManager X50 软件可以同时管理多达 50 台的 X50 系列 PCR 仪,极大地提高了实验室的运行效率。
随着疫苗接种工作的进行,疫苗接种场所检测到新冠病毒核酸阳性的可能性也随之增加,而二代测序将帮助我们更好地识别这些病毒是源自疫苗还是其他。可以预见,二代测序的应用将会越来越广泛,我们也就能更加快速地分清“假警报”。
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- Eppendorf epMotion 5073m NGS solution(已下架)
- 品牌:德国eppendorf
- 型号:epMotion 5073m NGS solution
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- Eppendorf epMotion 5075t/t NGS移液工作站
- 品牌:德国Eppendorf
- 型号:epMotion 5075t
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- Eppendorf epMotion 5073t NGS 工作站
- 品牌:德国Eppendorf
- 型号:epMotion 5073m NGS solution
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- Eppendorf Mastercycler X50 PCR仪器
- 品牌:德国Eppendorf
- 型号:Mastercycler X50