多肽合成定制与分析
2019-03-112157关于多肽合成,多肽的基本常见知识
1. 我该如何处理和保存多肽?
冻干粉形式的多肽,经密封包装可在常温条件下稳定运输,溶解状态的多肽不宜长期保存。
多肽保存指南:需要长期保存的多肽,应以冻干粉形式存放在含有干燥剂的密封容器内,置于-20°C保存,-80°C效果更好,可以Zda限度地避免多肽降解。这种储存方式可以使多肽可保存数年,避免了被细菌降解和氧化,也可以避免二级结构的形成。
打开包装: 在打开包装和称重前,请先将多肽在干燥器中平衡至室温。因多肽往往具有吸湿性,未经平衡到室温的多肽在打开盖子后易凝结,从而降低了多肽产品的稳定性。
称重: 迅速称取您所需的多肽,并将剩余多肽继续储存在-20°C或更低温度。与其他多肽相比,含有半胱氨酸、蛋氨酸、色氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和谷氨酸N -末端的多肽保存期更短。
2. 如何溶解多肽?
多肽的溶解性很大程度上取决于多肽的极性。酸性的蛋白溶解于碱性溶液,而碱性蛋白可溶解于酸性溶液,含有大量不带电荷的极性氨基酸残基或疏水性氨基酸的疏水性多肽和中性多肽可先溶解于少量有机溶剂中,如DMSO、DMF、醋酸、乙腈、甲醇、丙醇或异丙醇,然后加水(蒸馏水)稀释。含有甲硫氨酸或半胱氨酸的多肽不能用DMSO溶解,因为DMSO可能造成侧链氧化。
多肽溶解测试: 在多肽溶解之前先取小部分进行多肽溶解测试,您需要测试几种不同的溶剂,直到找到Z适当的一种。超声处理有助于打碎颗粒并增加溶解度。(注意: 超声处理会引起溶液发热和多肽降解。)
将每个酸性氨基酸赋值为-1,包括天冬氨酸(D)、谷氨酸(E)、以及羧基末端-COOH。每个碱性氨基酸赋值为+1,包括精氨酸(R)、赖氨酸(K)、组氨酸(H)以及氨基末端-NH2。然后计算整个多肽的电荷数。
如果整段肽所带电荷是阳性的,说明该肽是碱性的。可先尝SY蒸馏水来溶解;如果不溶于水,接着尝SY少量10%-25%醋酸溶解,如果仍然失败的话,添加一些TFA(10-50微升)来增溶,然后用水稀释至理想浓度。
如果整段肽所带电荷是阴性的,说明该肽是酸性的。酸性的多肽可以尝SYPBS(PH 7.4)来溶解,如果不溶的话,添加少量的碱性溶剂,如0.1 M的碳酸氢铵,然后加水稀释至理想浓度。含有游离半胱氨酸的多肽应溶于脱气的酸性缓冲液中,因为当PH值大于7时,巯基会被迅速氧化成二硫化物。
如果整段肽电荷是零,说明肽是中性的。中性肽通常溶于有机溶剂。首先,尝试添加少量乙腈、甲醇或异丙醇。对于高度疏水的多肽,可使用少量的二甲基亚砜溶解,然后用水稀释至理想浓度。对于含有自由半胱氨酸的肽,需使用DMF而不是DMSO。对于有聚集倾向的肽,可添加6M盐酸胍或8M尿素,然后进行必要的稀释。
为了防止或尽量减少多肽降解,请将多肽以冻干粉形式保存在-20°C,-80°C更佳。如果需要保存溶液肽,**分成小样存放,以避免反复冻融。一份样品融冻后未用完,应扔掉。细菌降解有时会成为溶液肽的麻烦,所以请将肽溶于无菌水或肽溶液过滤CJ。
碱性氨基酸: K, R, H, N-terminus
酸性氨基酸: D, E, C-terminus
极性中性氨基酸: F, I, L, M, V, W, Y
非极性疏水氨基酸: G, A, S, T, C, N, Q, P, 乙酰基,酰胺基
举例说明:
RKDEFILGASRHD: (+5) + (-4) = +1 认为是碱性多肽,见步骤2
EKDEFILGASEHR: (+4) + (-5) = -1 认为是酸性多肽,见步骤3
AKDEFILGASEHR: (+4) + (-4) = 0 认为是中性多肽,见步骤4
3.一个肽段是否可溶能预测吗?
我们无法通过研究多肽的结构来预测其在水中的溶解度。然而,赖氨酸的ε-氨基和精氨酸的胍通常有助于预测溶解度,尤其是短肽。与此相反,含有天门冬氨酸和谷氨酸的酸性肽往往是不易溶于水的,但易溶于稀氨水或碱性缓冲液。
4. 如何选择适合自己研究的多肽纯度?
粗品肽不推荐用于生物实验。粗肽可能含有大量的非肽类杂质,如残留的有机溶剂、清除剂、TFA和其他不完整肽。TFA不能被完全消除,通常交付的肽以TFA盐的形式存在。如果残留的TFA影响您的实验,我们推荐其他盐形式,如醋酸盐和盐酸盐等。这些盐通常比常规TFA盐贵20-30%以上。这是由于在转化过程中出现更多的肽损失和需要更多的原材料。
建议对各种项目采用以下级别的肽纯度:
>70% 肽纯度
肽微阵列
作为制备抗体的抗原
层析法
酶联免疫吸附试验检测抗血清滴度
>80% 肽纯度
免疫印迹法(非定量)
酶底物肽(非定量)
封闭肽(非定量)
亲和纯化
磷酸化检测
蛋白电泳的应用和免疫细胞化学
>95% 肽纯度
标准酶联免疫吸附试验和RIA(定量)
受体配体相互作用(定量)
体内、体外 生物学测定
酶的研究和阻断实验(定量)
NMR研究
质谱分析
其他定量检测
>98% 肽纯度
SAR研究
临床试验
APIs(药物活性成分)
工业品
X-ray晶体研究
其他敏感的实验:酶与底物、受体与配体相互作用、阻断和竞争实验
5. 什么是多肽的纯度?
多肽的纯度是指HPLC方法在214nm处检测到的目标多肽的含量(214nm是肽链的吸收波长),紫外分光光度计检测不到水和残留的盐不。可发现其他的杂质包括:缺失序列(缺失了一个或多个氨基酸残基的靶序列),截断序列(加帽过程中产生的序列)脱保护不完全序列(产生于整个合成过程或Z后的裂解过程)。
多肽纯化不涉及水和盐。HPLC纯化会产生少量的TFA,如:游离的氨基末端和其他侧链如Arg、Lys、His都可生成少量TFA杂质。通常交付的多肽多含有微量TFA和残留水。即使处于冻干状态,水也会因共价结合的能力不同而不同程度地存在着。
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