单细胞分选器分选要考虑的问题
2022-06-22298单细胞分选器分选要考虑的问题。众所周知传统的生物学分析方法常见的研究对象就属群体细胞了,可这么一来使得细胞之间的生物学差异可能会相互掩盖,生物信息容易消失在大背景中。由于基因随机表达的细胞异质性,很难解释细胞和细胞之间的在转录和翻译水平的差异 ,所以在单细胞层面研究基因组学、表观基因组学和转录组学就显得尤为重要了。
单细胞分选器以单细胞测序应用为例,想在单个细胞水平上进行测序,首先就需要将它们从群体细胞中分离出来,那么单细胞的精 准分离则是后续完成准确测序的前提, 就提到几种单细胞分选方法。
利用流式细胞分选技术进行的单细胞分选,具有精度高、通量大、分选参数多,成本相对低等优点。
但要通过流式分选出足够多的符合要求的单细胞进行下游实验并没有那么容易。下面三方面是必须要考虑的问题:
1、活性
细胞活性状态对后续实验而言非常重要,就拿转录组分析为例,无论是RNA-Seq还是高通量表达谱芯片技术,都需要高质量的RNA样本,细胞活性不好或死细胞会直接导致RNA降解,实验无法继续。
2、精度
流式分选是精密度超高的仪器,稍稍不同的参数(激光、液流等)的设置都会直接造成结果偏差;另外既然是想研究单细胞,那么就得确保分选得到的确为单个细胞,否则同样没有意义。
3、效率
自动化替代人工无疑是提高效率、节省成本的有力举措;当你需要分选超低含量的细胞时,务必是个长时间工程,鞘液用光时,其更换繁琐度、耗时、连续性等都是需要考虑的。
如此看来,单细胞分选确实不容易。 幸好,科技的进步, 使得单细胞分选,如同玩电脑一般简单。利用空气激发和温控系统,实现了高活性分选。
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