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石蜡包埋对dna甲基化有影响吗

2729103757 2017-07-10
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忆饱商
从石蜡包埋组织中提取DNA的基本步骤,是在常规DNA提取方法的基础上改良和演变而业。Goelz等(1985)Z先提出的石蜡包埋组织DNA提取技术,是用机械的方法破碎组织,切除多余的石蜡,进入含SDS和高浓度蛋白酶K(1mg/ml)的提取缓冲液加温孵育,然后进行苯酚和氯仿抽提。 所得DNA虽不完整,但可被限制性内切酶切割,因而适于点杂交,印迹杂交等多种分了生物学实验。

Dubeau等(1986)在上述方法上作了改进。 首先通过组织切片和二甲苯和脱蜡,保证了组织的完全破碎,使细胞与消化液充分接触,使DNA释放和蛋白去除更加完全;其次通过两步消化的方法,将不适于做分子杂交的降解的DNA小段去除,仅保留那些可螺旋化的完整的DNA分子,从而提DNA质量,适于做Sorthern印迹杂交分析。Moerkerk等(1990)对上述两种方法进行了比较,发现两种方法所提行DNA之点杂交结果一致,非螺旋化DNA亦不影响杂交分析。

Goelz氏DNA提取方法的主要步骤

1. 切除多余石错,暴露组织

2. 将组织切碎(Z大径<0.5mm),称重;

3. 溶于TE9提取液(组织<50mg/5ml.50-500mg/10ml),高速混悬2-3min,于48℃放置24h(TE9提取液的制备;500mmol/L Tris;20mmol/L EDTA;10mmol/L NaCl;1% SDS;500µg/ml 蛋白酶K;pH8.0)

4. 再次混悬组织,加入蛋白酶K至终浓度1mg/ml,SDS至2%,孵育40h;

5. 用等体积酚-氯仿溶液抽提3次;

6. 2.5倍体积乙醇沉淀DNA

7. -70℃放置2-4h

8. 9 000xg离心1h

9. 沉淀物用70%乙醇洗1次

10. 干燥,TE(pH7.2)溶解。
17 0 2017-07-11 0条评论 回复
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