如何运用克隆文库法分析土壤真菌微生物多样性

如何运用克隆文库法分析土壤真菌微生物多样性
按照我理解的“土壤中微生物的种类”是指古菌、细菌、真菌等生命体而不包括藻类、原生动物等低等动植物.
土壤中微生物的种类数量的调查属于微生态区系分析的范畴.
一般说来，我们所开展的研究工作主要采用以下两类方法进行研究分析：
1、经典的选择培养法：
即采用选择培养的方法，对土壤样品中的细菌、放线菌、酵母菌、丝状真菌等几大类微生物进行分类培养，还可以采用详细的选择培养方式比如无氮培养基培养固氮微生物、利用MPN法测定氮循环微生物等等，从功能角度再细分一下微生物的种类组成；还可以通过寡营养、富营养、长周期培养等方法做进一步详细的分析.
此类方法工作量大，分析精度和全面性都有一定的局限性.但同时是任何层面的研究都不可以忽略的方式方法，是获得微生物菌种资源纯培养以进行深入研究的唯yi方法.
2、分子微生态学方法
是基于DNA分析和测序基础上的分子微生态学研究方法，常用的有DGGE（变性梯度凝胶电泳）、克隆文库构建、T-RFLP以及宏基因组技术，对样品中的DNA进行电泳乃至测序分析，从分子水平确定样品中微生物的种类和数量.
从全面性和深度以及工作效率方面都教常规方法有大幅度提升，但目前仍然有不成熟的地方.另外其成本远高于常规方法.