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- CH68453622 2018-04-22 00:00:00
- 基因组调研图研究是对于没有基因组参考序列的物种，基于小片段文库的低深度测序数据，可以有效地评估基因组大小、GC含量、杂合度高低以及重复序列含量等信息，是全面了解某一物种基因组特征的有效方法；此外，通过基因组调研分析也可对基因组进行初步组装。 项目周期： 动植物基因组Survey开发时间为6周；3个样品或以上，以及基因组大于1G为2个月。 开发时间以样品到位并检测合格为前提；收到样品后，需要对样品进行检测，Z终样品的量和纯度，以公司的检测结果为准。 测序平台及策略： 整体测序深度不低于30倍覆盖度； 预测基因组大小，评估基因组GC含量，评估基因组杂合率； 确定精细图梯度文库构建具体策略 技术路线： 分析内容： 1.标准信息分析 数据基本处理，去低质量和接头序列； K-mer 分析以及基因组大小估计； 杂合率估计； 精细图建库方案评估； 2.高级信息分析（只针对纯调研图项目） 初步组装； GC-Depth 分布分析，判断测序偏好性； SSR标记鉴定； 样品间SNP鉴定（多样本情况下）。
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