重测序比较两个样品之间的差异，为什么要跟参考基因

基因组调研图研究是对于没有基因组参考序列的物种，基于小片段文库的低深度测序数据，可以有效地评估基因组大小、GC含量、杂合度高低以及重复序列含量等信息，是全面了解某一物种基因组特征的有效方法；此外，通过基因组调研分析也可对基因组进行初步组装。
项目周期：
动植物基因组Survey开发时间为6周；3个样品或以上，以及基因组大于1G为2个月。
开发时间以样品到位并检测合格为前提；收到样品后，需要对样品进行检测，Z终样品的量和纯度，以公司的检测结果为准。
测序平台及策略：
整体测序深度不低于30倍覆盖度；
预测基因组大小，评估基因组GC含量，评估基因组杂合率；
确定精细图梯度文库构建具体策略
技术路线：

分析内容：
1.标准信息分析
数据基本处理，去低质量和接头序列；
K-mer 分析以及基因组大小估计；
杂合率估计；
精细图建库方案评估；
2.高级信息分析（只针对纯调研图项目）
初步组装；
GC-Depth 分布分析，判断测序偏好性；
SSR标记鉴定；
样品间SNP鉴定（多样本情况下）。