说起代谢组数据分析软件,可能大家diyi个想到的就是SIMCA-P。SIMCA-P (http://umetrics.com/products/simca)软件是由Umetrics公司在1987研究开发,目前是一款公认的多元变量统计分析软件,被绝大多数代谢组服务提供商所采用。SIMCA-P虽然是一款强大的多元变量统计分析软件,但也有不足之处:
SIMCA-P是一款商业软件,需要收费(但有30天免费SY),windows版本的。对于想使用免费软件的老师来说,不那么友好;
代谢组数据的分析除了多元变量统计分析,还有原始数据前处理(pre-processing)、数据处理(processing)、单变量统计分析等,很显然SIMCA-P并不能满足我的所有愿望……