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biospin 质粒DNA小量提取试剂盒

阿飞lufei 2011-11-13
问题一:biospin质粒DNA小量提取试剂盒中有瓶试剂叫washbuffer,需要加入无水乙醇,请问加入无水乙醇的作用是什么?问题二:今天做胶回收的时候不小心选择了没有加无水乙醇的试剂,不知... 问题一:biospin 质粒DNA小量提取试剂盒中有瓶试剂叫wash buffer,需要加入无水乙醇,请问加入无水乙醇的作用是什么? 问题二:今天做胶回收的时候不小心选择了没有加无水乙醇的试剂,不知道如何补救?做胶回收的wash buffer 和提质粒用的应该是一样的吧。 问题三:使用此试剂盒提取质粒时是是如何分离质粒和基因组DNA的? 请高手详细指教,回答的好会再追加分的。
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lqqqianqi
1.wash buffer中加入无水乙醇后,终浓度差不多就是70%的乙醇溶液了,在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,wash buffer就是洗去这些盐杂质的。
2.用无水乙醇沉淀DNA,这是实验中Z常用的沉淀DNA的方法。乙醇的优点是可以任意比和水相混溶,乙醇与核酸不会起任何化学反应,对DNA很安全,因此是理想的沉淀剂。DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。一般实验中,是加2倍体积的无水乙醇与DNA相混合,其乙醇的Z终含量占67%左右。因而也可改用95%乙醇来替代无水乙醇(因为无水乙醇的价格远远比95%乙醇昂贵)。但是加95%的乙醇使总体积增大,而DNA在溶液中有一定程度的溶解,因而DNA损失也增大,尤其用多次乙醇沉淀时,就会影响收得率。折中的做法是初次沉淀DNA时可用95%乙醇代替无水乙酵,Z后的沉淀步骤要使用无水乙醇。也可以用0.6倍体积的异丙醇选择性沉淀DNA。一般在室温下放置15-30分钟即可。如果你没有加无水乙醇,核酸不能沉淀,都随洗液弃掉了。
3.十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),钾离子置换了SDS中的钠离子形成了不溶性的PDS,而高浓度 的盐,使得沉淀更完全。大家知道SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质 沉淀了,让人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。这个过程不难想象,因为基因组DNA太长了,长长的DNA自然容易被PDS给共沉淀了,尽管SDS并不与DNA分子结合。
需要特别说明的是:醋酸的加入是为了中和NaOH,因为长时间的碱性条件会打断DNA,所以要中和之。基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被PDS共沉淀了。所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然Z后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入。
12 0 2011-11-17 0条评论 回复
heitiansh1
一、乙醇是核算的沉淀剂,也可以洗脱醇溶性杂质。
二、应该没法补救了。一样的。
三、基因组DNA分子很大链很长,在起初的蛋白质沉淀时,绝大部分已经缠绕在一起沉淀下去了,此外,试剂盒中套管中的纤维膜只能特异的吸附几百至几千bp的DNA片段,小的不能吸附,大的不能被洗脱下去,因此可以很好分离大分子量的基因组DNA和较小分子量的质粒DNA
17 0 2011-11-14 0条评论 回复
潜新儿
wash buffer其实是70%的无水乙醇,其目的是“wash”,也就是洗去柱子上残余的盐分其他成分。
没有加无水乙醇,那就悲剧了,柱子上的DNA在这一步已经被洗的差不多了,都脱下了。做胶回收的wash buffer应该是成分类似,但不同公司,或不同的柱芯,其成分可能有差异。
使用试剂盒提取质粒,分离基因组DNA,其原理还是碱裂解法的原理:当菌体在NaOH和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性 而呈絮状,离心时可沉淀下来。
14 0 2011-11-14 0条评论 回复
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