提取核酸时,加入蛋白酶后为什么要加热到65摄氏度
请注意:SDS对于脱氧核糖核酸酶以及核糖核酸酶均有YZ作用.
这里提供的是由Marmur于1961年建立,经Dale等人简化和发展,此方法略加修改后可用于其他细菌种类.主要原理是:采用去垢剂破碎细菌细胞,酚-氯仿萃取蛋白,使用核糖核酸酶和蛋白酶K进行进一步的纯化,所提取的DNA无RNA和蛋白质污染,可用于限制性内切酶消化,分子克隆.
⑴材料
①20倍SSC缓冲液:3mol/l NaCl; 0.3mol/l 醋酸钠;pH 7.0(高压灭菌后,4摄氏度保存可长期使用)
②酚/氯仿(1:1):一般市售的酚需要重蒸处理,市售的酚常含有杂质而呈粉色和淡黄色,需要重蒸二次,收集沸点160℃部分,小瓶分装,瓶内空腔充氮气,-20℃密封保存,以免氧化,用前从冰箱中取出,68℃蒸馏水饱和,加入8—羟基喹啉(100g酚加0.1g),酚变为黄色.8—羟基喹啉是抗氧化剂,并能部分YZ核糖核酸酶,含8—羟基喹啉的酚用等体积1.0mol/L pH 8.0Tris 缓冲液抽提,再用0.1mol/L pH 8.0含0.2%β-巯基乙醇的Tris缓冲液抽提数次,酚溶液的pH应大于7.6.此酚溶液在平衡缓冲液覆盖下4℃可保存一个月,纯化和制备酚溶液都要带手套,以免损伤皮肤.
③核糖核酸酶:无DNA酶污染,将胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/LTris-Cl(pH 7.5)15mmol/L Nacl 溶液中,浓度为10mg/ml.于100℃加热15分钟,缓慢冷却至室温,分装后于-20℃保存.
④蛋白酶K
⑤TES缓冲液:10mmol/L Tris-HCl, pH 8.0; 10mmol/L NaCl;1mmol/l EDTA
⑵方法
①取单菌落接种于5mlLB培养液中,37℃振荡培养过夜.(使用试管)
②将上述菌液接种于200mlLB培养液中,37℃振荡培养过夜.(使用500ml或1000ml三角瓶)
③离心,收集沉淀(5000r/m,10分钟)
④将沉淀悬浮于20ml 20倍SSC缓冲液中,混匀.
⑤加入200mg SDS,室温下振荡过夜,使细菌细胞充分裂解,裂解液呈粘稠状
⑥加入等体积的酚/氯仿溶液,温和地混匀,细心地回收上层水相(注意不要触及二相之界面),重复萃取三次
⑦加入2倍体积无水乙醇,此时可见到絮状DNA沉淀或用玻璃棒绕取收集
⑧将DNA溶于15ml 2倍SSC溶液中,加入核糖核酸酶(Z终浓度50ug/ml),37℃保温1小时
⑨加入蛋白酶K(50ug/ml),继续保温1小时
⑩加入等体积苯酚萃取一次,在回收的水相中加入2.5倍体积的无水乙醇,-20℃静止过夜
25000g,4℃,离心15分钟,收集沉淀,用-20℃无水乙醇洗涤一次;将DNA在真空干燥器中抽干,溶于10mlTES缓冲液中,4℃保存备用.