分子量小于800的化合物用EI-MS,ESI-MS给出的碎片离子少,但是可以得到确切分子量,EI-MS碎片离子信息多,利于猜测化合物母核。
ESI源是一种软电离方式,主要应用于液相色谱-质谱联用仪。即便是分子量大,稳定性差的化合物,也不会在电离过程中发生分解,它适合于分析极性强的大分子有机化合物,如蛋白质、肽、糖等。ESI源Z大的特点是容易形成多电荷离子。
EI源是应用Z为广泛的离子源,它主要用于挥发性样品的电离。有些化合物稳定性差,用EI方式不易得到分子离子,因而也就得不到分子量。为了得到分子量可以采用CI电离方式。EI和CI源主要用于气相色谱-质谱联用仪,适用于易汽化的有机物样品分析。