蛋白质之间相互作用的研究方法有哪些

研究DNA-蛋白质相互作用的实验方法主要包括：a、凝胶阻滞实验； b、DNase 1 足迹实验；c、甲基化干扰实验； d、体内足迹实验； f、拉下实验。研究蛋白质/ 核酸相互作用近期采用的新技术有：核酸适体技术、生物信息学方法、蛋白质芯片技术以及纳米技术等。
蛋白（绿色荧光蛋白或红色荧光蛋白）的载体中，共转染到功能细胞中（一般选用 COS7 细胞）表达带有荧光的融合蛋白.这样，相互作用的两种蛋白就被标上不同的荧光，可以在细胞内用荧光显微镜直接观测.在进行精确细胞定位或共定位时，必须用共聚焦荧光显微镜观测.因为共聚焦荧光显微镜（相当于医院给病人诊断的 CT）观测的是细胞内一个切面上的颜色.如果在一个切面上在同一区域看到两种颜色，就提示这两种蛋白在该区域内有相互作用.普通荧光显微镜看到的是一个立体图象，无法确定蛋白质共定位现象.在进行定位或共定位同时，也可以对细胞核进行染色.这样，在细胞中就有三种颜色.细胞核的显色帮助你确定共定位发生的位置.上面介绍的活细胞定位，其优点是表达的荧光蛋白荧光强，没有背景，观测方便.